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RAGO ANOUK

14h00

Soutenance de thèse de ANOUK RAGO

Inférence de réseaux de gènes dynamiques et prédiction d'expériences d'interventions biologiques dans des cellules cancéreuses

Inference of dynamic networks of genes and prediction of biological interventions experiments in cancer cells

Jury

Directeur de these_GEGOUT-PETIT_Anne_Université de Lorraine
Rapporteur_LèBRE_Sophie_Université Paul Valéry Montpellier
Rapporteur_GENUER_Robin_Université de Bordeaux
CoDirecteur de these_CHAMPAGNAT_Nicolas_INRIA
Examinateur_DEACONU_Madalina_Centre INRIA de l'université de Lorraine
Examinateur_MARTIN_Marie-Laure_INRAE Ile-de-France--Versailles-Saclay
Examinateur_VALLAT_Laurent_Université de Strasbourg
Examinateur_DUMOND_Hélène_Université de Lorraine

école doctorale

IAEM - INFORMATIQUE - AUTOMATIQUE - ELECTRONIQUE - ELECTROTECHNIQUE - MATHEMATIQUES

Laboratoire

IECL - Institut Elie Cartan de Lorraine

Mention de diplôme

Mathématiques
Salle de conférences Institut Elie Cartan de Lorraine Faculté des Sciences et technologie Campus, Boulevard des Aiguillettes BP 70239 54506 Vandœuvre-lès-Nancy
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Mots clés

inférence de réseaux de gènes,données temporelles,leucémie,prolifération cellulaire,régression linéaire pénalisée,forêts aléatoires

Résumé de la thèse

Dans la plupart des cancers, l'accumulation d'aberrations génétiques altère progressivement les programmes géniques cellulaires, conduisant à des comportements aberrants et à la prolifération cellulaire incontrôlée. Un projet multidisciplinaire a été initié en collaboration avec une équipe du CHU de Strasbourg afin de caractériser et modéliser le programme prolifératif d'un cancer du sang.

Keywords

gene network inference,temporal data,leukemia,cell proliferation,penalized linear regression,random forests

Abstract

In most cancers, the accumulation of genetic aberrations progressively alters cellular gene programmes, leading to absurd behaviour and uncontrolled cell proliferation. A multi-disciplinary project has been initiated in collaboration with a team from Strasbourg Hospital to characterise and model the proliferative programme of leukemic cells. To this end, temporal gene and protein expression data from ill patients were collected, with the aim of characterising the transcriptional dynamics of cancer cells.
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