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Cartographie des propriétés électriques du corps humain en imagerie par résonance magnétique (IRM)

Offre de thèse

Cartographie des propriétés électriques du corps humain en imagerie par résonance magnétique (IRM)

Date limite de candidature

15-09-2026

Date de début de contrat

01-10-2026

Directeur de thèse

ODILLE Freddy

Encadrement

Réunions individuelles au minimum hebdomadaires entre le(s) directeur(s) de thèse et le doctorant. Intégration au sein d'une équipe de doctorants/chercheurs sur la thématique de l'imagerie des organes en mouvement (réunion scientifiques hebdomadaires). Accès recherche dédié sur les IRM cliniques du CHRU de Nancy pour acquisition sur fantômes, volontaires sains et patients (formation sécurité IRM, recrutement et gestion des protocoles éthiques en partenariat avec le CIC-IT 1433). Participation du doctorant à un congrès international par an pendant la thèse. Organisation d'un comité de suivi de thèse.

Type de contrat

Concours pour un contrat doctoral

école doctorale

IAEM - INFORMATIQUE - AUTOMATIQUE - ELECTRONIQUE - ELECTROTECHNIQUE - MATHEMATIQUES

équipe

contexte

Les propriétés électriques des tissus biologiques caractérisent la manière dont ceux-ci réagissent lorsqu'ils sont soumis à des champs électromagnétiques. Ces propriétés sont nommées la conductivité et la permittivité électriques. En particulier, la conductivité électrique, notée σ, traduit l'aptitude des charges électriques se trouvant dans les tissus à se déplacer et à générer un courant électrique (j ⃗=σE ⃗). La connaissance des propriétés électriques est requise dans de nombreuses applications biomédicales et industrielles. Les propriétés électriques des tissus étant dépendantes de la structure des tissus et de leur composition (eau, concentration ionique, structure cellulaire…), elles peuvent être modifiées lors de l'altération du tissu suite à une pathologie (par exemple une tumeur ou un kyste dans le foie, cf Fig. 1) et ainsi fournir des informations diagnostiques, également appelées des biomarqueurs (1). De plus, lors de l'interaction entre un champ électromagnétique et un tissu biologique - comme c'est le cas en téléphonie mobile, ou lors d'un examen d'imagerie par résonance magnétique (IRM) - il est nécessaire d'estimer la quantité d'énergie électromagnétique absorbée (ou débit d'absorption spécifique, DAS) pour la sécurité de l'utilisateur ou du patient. De même, lors d'un traitement de thermo-ablation d'une lésion par micro-ondes, une modélisation plus précise de cette énergie délivrée à la lésion cible et aux tissus sains environnants est nécessaire pour optimiser l'efficacité du traitement. Ces estimations d'énergie absorbée requièrent de connaître précisément la conductivité des tissus (2). Figure 1 - Images IRM conventionnelles en pondération T1 (à gauche) et cartes de conductivité électrique reconstruites (à droite), chez un sujet présentant une tumeur hépatique bénigne (Subject 1) et un kyste (Subject 2). Travaux du laboratoire IADI, Z. He et al., ISMRM 2024. En raison de son principe physique fondée sur l'électromagnétisme, l'Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) offre la possibilité d'imager ces propriétés électriques (3) et ceci à une résolution proche du centimètre, voire du millimètre. En IRM, des antennes radiofréquences (RF) émettant une impulsion RF à la fréquence de Larmor (64 MHz à 1.5 T, 128 MHz à 3 T) sont utilisées pour créer le signal IRM. Les images obtenues sont complexes (module et phase) et dépendent notamment de l'interaction électromagnétique entre l'onde RF émise et le sujet imagé. Cette « signature » RF dans les images IRM est fonction de la conductivité et de la permittivité des tissus, et toute l'essence de la Magnetic Resonance Electrical Properties Tomography (MR-EPT) consiste à extraire cette signature RF des images pour ainsi quantifier la conductivité et permittivité des tissus. Au cours des travaux précédents du laboratoire (cf Fig. 2), nous avons validé les mesures par IRM par rapport à la méthode de référence (4), et nous avons obtenu des résultats préliminaires concernant les valeurs observées in-vivo et leurs variations dans la population (5). Les limites des techniques précédemment développées sont : 1) la résolution spatiale effective des cartes de conductivité reste modeste (5 à 10 mm) au regard du potentiel de l'IRM (< 1 mm) : 2) dans les organes de la cage thoracique et de l'abdomen, les mouvements respiratoires et cardiaques imposent des contraintes supplémentaires sur la résolution spatiale.

spécialité

Automatique, Traitement du signal et des images, Génie informatique

laboratoire

IADI - Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle

Mots clés

Imagerie par Résonance Magnétique, Traitement du signal et de l'image

Détail de l'offre

Le projet de thèse vise à développer de nouvelles méthodes en imagerie par résonance magnétique (IRM) visant à l'acquisition, la reconstruction et l'analyse d'images pour la cartographie des propriétés électriques des tissus dans le corps humain. Les propriétés électriques (conductivité et permittivité) caractérisent le comportement du milieu en réponse à une stimulation électromagnétique, et sont influencées par la composition des tissus, leur structure, le contenu en eau, la concentration ionique etc… Les techniques récentes de cartographie en 3D par IRM offrent de nouvelles perspectives pour de nombreuses applications biomédicales diagnostiques, comme la caractérisation des lésions pathologiques/tumorales, ou interventionnelles, comme le calcul de la dose électromagnétique délivrée aux tissus (débit d'absorption spécifique, DAS) lors d'une procédure de thermo-ablation par micro-ondes. Ces techniques présentent néanmoins certaines limites, sur lesquelles le travail de thèse se concentrera : 1) la résolution spatiale effective des cartes de conductivité reste modeste (5 à 10 mm) au regard du potentiel de l'IRM (< 1 mm) : 2) dans les organes de la cage thoracique et de l'abdomen, les mouvements respiratoires et cardiaques imposent des contraintes supplémentaires sur la résolution spatiale. Pour résoudre ces défis, de nouvelles techniques de calcul numérique seront étudiées pour l'étape de reconstruction des images, et de nouvelles stratégies de programmation des séquences d'acquisition seront mises en œuvre. Enfin, de nouveaux modèles électromagnétiques seront créés pour les applications diagnostiques et pour l'estimation du DAS.

Keywords

Magnetic Resonance Imaging, Signal and image processing

Subject details

The PhD project aims to develop new methods in magnetic resonance imaging (MRI) for the acquisition, reconstruction, and analysis of images to map the electrical properties of tissues in the human body. Electrical properties (conductivity and permittivity) characterize the behavior of a medium in response to electromagnetic stimulation and are influenced by tissue composition, structure, water content, ion concentration, etc. Recent 3D MRI mapping techniques offer new perspectives for many diagnostic biomedical applications, such as the characterization of pathological/tumoral lesions, or for interventional applications, such as calculating the electromagnetic dose delivered to tissues (specific absorption rate, SAR) during a microwave thermo-ablation procedure. However, these techniques have certain limitations, which the thesis work will address: 1) the effective spatial resolution of conductivity maps remains modest (5 to 10 mm) compared to the potential of MRI (< 1 mm); 2) in the organs of the thorax and abdomen, respiratory and cardiac motions impose additional constraints on spatial resolution. To overcome these challenges, new numerical computation techniques will be investigated for the image reconstruction step, and new programming strategies for acquisition sequences will be implemented. Finally, new electromagnetic models will be developed for diagnostic applications and for SAR estimation.

Profil du candidat

- Formation : M2 ou ingénieur dans une des disciplines suivantes : sciences de l'ingénieur, ingénierie biomédicale, physique, mathématiques, sciences des données. Une expérience (stage M2) dans le domaine de l'IRM ou de l'imagerie médicale est un plus.
- Curieux, autonome, dynamique, présentant un vif intérêt pour la recherche et l'imagerie médicale.
- Bonne maîtrise de l'anglais et des outils de programmation scientifique (notamment Matlab ou Python).
- Bonnes capacités de communication.

Candidate profile

- Education : M.Sc. or equivalent in one of the following fields: engineering, biomedical engineering, physics, mathematics, data science. Experience (M.Sc. internship) in MRI or medical imaging would be an advantage.
- Curious, ability to work independently, motivated, high interest in research and medical imagiing
- Good written and spoken English skills and good scientific programming skills (e.g. Matlab)
- Good communication skills

Référence biblio

1. Zhang X, Liu J, He B. Magnetic-resonance-based electrical properties tomography: a review. IEEE Rev Biomed Eng. 2014;7:87–96. doi:10.1109/RBME.2013.2297206 PubMed PMID: 24803104; PubMed Central PMCID: PMC4113345.
2. Katscher U, Voigt T, Findeklee C, Vernickel P, Nehrke K, DÖssel O. Determination of Electric Conductivity and Local SAR Via B1 Mapping. IEEE Trans Med Imaging. 2009 Sep;28(9):1365–74. doi:10.1109/TMI.2009.2015757
3. Haacke EM, Petropoulos LS, Nilges EW, Wu DH. Extraction of conductivity and permittivity using magnetic resonance imaging. Phys Med Biol. 1991 Jun;36(6):723–34. doi:10.1088/0031-9155/36/6/002
4. He Z, Lefebvre PM, Soullié P, Doguet M, Ambarki K, Chen B, et al. Phantom evaluation of electrical conductivity mapping by MRI: Comparison to vector network analyzer measurements and spatial resolution assessment. Magn Reson Med. 2024 Jun;91(6):2374–90. doi:10.1002/mrm.30009 PubMed PMID: 38225861.
5. He Z, Soullié P, Lefebvre P, Ambarki K, Felblinger J, Odille F. Changes of in vivo electrical conductivity in the brain and torso related to age, fat fraction and sex using MRI. Sci Rep. 2024 Jul 12;14(1):16109. doi:10.1038/s41598-024-67014-9
6. He Z, Chen B, Lefebvre PM, Odille F. An Adaptative Savitzky-Golay Kernel for Laplacian Estimation in Magnetic Resonance Electrical Property Tomography*. In: 2023 45th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine & Biology Society (EMBC) [Internet]. 2023 [cited 2026 Mar 31]. p. 1–4. Available from: https://ieeexplore.ieee.org/document/10341200 doi:10.1109/EMBC40787.2023.10341200
7. Soullié P, Missoffe A, Ambarki K, Felblinger J, Odille F. MR electrical properties imaging using a generalized image-based method. Magn Reson Med. 2021;85(2):762–76. doi:https://doi.org/10.1002/mrm.28458
8. Lohrengel S, Milano C, Salmon S. Electrical properties reconstruction from MRI data: theoretical and numerical aspects. Inverse Probl Imaging. 2025 Nov 12;23(0):123–51. doi:10.3934/ipi.2025057