Offre de thèse
CD - Conception in silico et synthèse de précurseurs d'intercalants de l'ADN
Date limite de candidature
10-05-2026
Date de début de contrat
01-10-2026
Directeur de thèse
BOISBRUN Michel
Encadrement
Co-direction 50% : Emmanuelle Bignon (laboratoire LPCT) suite à attribution de financement de thèse interlaboratoire par le Pôle CPM.
Type de contrat
école doctorale
équipe
SAMPAcontexte
Face aux marges thérapeutiques limitées des chimiothérapies conventionnelles, le développement de nouvelles options thérapeutiques est toujours d'actualité. Ce projet doctoral consiste à concevoir des agents cytotoxiques classiques (intercalants de l'ADN) mais bio-activables par une méthode originale en cours de protection juridique par notre équipe.spécialité
Chimielaboratoire
L2CM - Laboratoire Lorraine de Chimie MoléculaireMots clés
Synthèse organique, Modélisation moléculaire, Intercalants de l'ADN
Détail de l'offre
Face aux marges thérapeutiques limitées des chimiothérapies conventionnelles, le développement de nouvelles options thérapeutiques est toujours d'actualité. Ce projet doctoral consiste à concevoir des agents cytotoxiques classiques (intercalants de l'ADN) mais bio-activables par une méthode originale en cours de protection juridique par notre équipe. Il repose sur une collaboration pluridisciplinaire : synthèse organique des molécules cibles, modélisation moléculaire pour l'exploration des modes de liaison à l'ADN et l'optimisation rationnelle des structures, et biologie cellulaire pour l'étude des interactions molécule-ADN et des effets anticancéreux sur cultures cellulaires. Le travail de thèse combinera chimie organique et modélisation moléculaire. Il consistera à la synthèse de ces molécules par des méthodes multi-étapes, et à la réalisation de calculs de chimie computationnelle (calculs quantiques et simulations de métadynamique) pour guider les choix de synthèse. Les calculs permettront d'explorer les modes de liaison des molécules à l'ADN (comme illustré dans la figure ci-contre), en complémentarité avec les tests de biologie cellulaire menés par notre partenaire (ONCOLille Cancer Institute). Cette stratégie ouvre la voie à de nouvelles perspectives thérapeutiques.
Keywords
Organic synthesis, Molecular modelisation, DNA intercalators
Subject details
Since usual chemotherapy treatments exhibit narrow therapeutic range, the development of safer and more active derivatives is still urgently required. The present project aims at building up new chemical entities showing classical mode of action (DNA intercalation) but through a new bioactivation process which is just being patented by us. The global project involves many complementary tasks: organic synthesis of target molecules, molecular modelisation to explore their DNA binding modes and for the rational optimisation of the compounds, and cellular biology to study DNA-molecules interactions and to evaluate their antiproliferative activity on cell cultures. Here, the PhD thesis will combine organic chemistry and molecular modelisation. Multi-step chemical synthesis will afford the attempted molecules, while computational chemistry calculations (quantic calculations and metadynamic simulations) will help choosing the best molecular candidates. Binding modes to DNA will also be deciphered thanks to calculations (see Figure), together with cellular biology studies arising from our biologist partner (ONCOLille Cancer Institute). This strategy paves the way towards new therapeutic opportunities.
Profil du candidat
Le(a) candidat(e) aura une solide formation et une expérience éprouvée en synthèse organique, avec une maîtrise des techniques analytiques usuelles. Il/Elle aura aussi des connaissances sérieuses et sera motivé(e) par la chimie théorique. Idéalement il/elle sera aussi intéressé(e) par le travail à l'interface entre la chimie et la biologie pour des applications biomédicales.
La capacité à mener une recherche bibliographique approfondie et à présenter clairement les résultats scientifiques, ainsi qu'une bonne maîtrise de l'anglais scientifique seront un plus.
Candidate profile
The candidate should have a strong knowledge in organic chemistry, with a fruitful experience in experimental work, and mastering usual analytic techniques. He/she should also be motivated by theoretical chemistry in which he/she should have a good knowledge. Ideally, he/she would be interested in working at the chemistry/biology interface for biomedical applications.
A strong ability to lead a deep bibliographic study and to clearly present scientific results would be appreciated, together with scientific English fluency.
Référence biblio
WHO report on cancer: setting priorities, investing wisely and providing care for all. Geneva: World Health Organization; (2020). Licence: CC BY-NC-SA 3.0 IGO.
Siegel, R. L., Miller, K. D., Fuchs, H. E., & Jemal, A. (2022). Cancer statistics, 2022. Ca Cancer J Clin, 72(1), 7-33.