Approches pluridisciplinaires pour l'étude de l'adhésion et du transport de Shewanella oneidensis en écoulement confiné
Multidisciplinary approaches for studying the adhesion and transport of Shewanella oneidensis in confined flow
Jury
Directeur de these_MATHIEU_Laurence_EPHE
CoDirecteur de these_LOUVET_Nicolas_Université de Lorraine
Président_PLOUX_Lydie_Université de Strasbourg
Rapporteur_BRIANDET_Romain_INRAE AgroParisTech
Rapporteur_AURADOU_Harold _Université Paris-Saclay
Examinateur_DAVIT_Yohan_Université de Toulouse
école doctorale
BioSE - Biologie Santé Environnement
Laboratoire
LCPME - Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l'Environnement
Mention de diplôme
Sciences de la Vie et de la Santé - BioSE
Salle des thèses d'Odontologie
Campus Brabois Santé, 7 avenue de la Forêt de Haye 54 500 Vandoeuvre-lès-Nancy
Mots clés
Adhésion pionnière,Transport bactérien,Hydrodynamique,Deep Learning,Microscopie holographique,Shewanella oneidensis,
Résumé de la thèse
Ce travail de thèse vise à la compréhension des premières étapes de l'adhésion bactérienne aux surfaces, de la dynamique de transport jusqu'à la colonisation initiale par les bactéries pionnières, grâce au développement d'approches pluridisciplinaires. Ces dernières nous ont permis d'accéder aux hétérogénéités populationnelles en travaillant à l'échelle individuelle, tout en analysant simultanément un grand nombre de bactéries.
Keywords
Pioneer adhesion,Bacterial transport,Hydrodynamics,Deep Learning,Holographic microscopy,Shewanella oneidensis,
Abstract
This thesis work aims at understanding the first steps of bacterial adhesion to surfaces, from transport dynamics to initial colonization by pioneer bacteria, through the development of multidisciplinary approaches. These approaches have enabled us to study population heterogeneity on an individual scale while analyzing a large number of bacteria simultaneously.
